Загадочное существо уничтожило 70% Луны. Также оно предупреждает, что если его не убьют до марта следующего года, Земля будет следующей уничтоженной планетой. Существо требует назначить его классным руководителем в школе «Кунугигаока», и правительство не в силах отказать, поэтому существо становится классным руководителем выпускного класса, в котором учатся хулиганы и бездельники. Ученики дают новому учителю имя Куро, что по-японски означает «чёрный». Правительство просит старшеклассников
В стране Аместрис алхимия широко распространена как точная наука. Два брата Эдвард и Альфонс Элрики ещё детьми пытались при помощи алхимии воскресить мёртвую маму, но поплатились за это. Старший лишился руки и ноги, младший — всего тела, хотя и был в самый последний момент чудом спасен — брат привязывает его душу к стальным рыцарским доспехам. Теперь два брата — первый со стальными протезами, второй — просто говорящий доспех — ищут философский камень, чтобы вернуть тело Альфонса.
Братья Элрик противостоят серийному убийце с шрамом на лбу.
Братья Элрик сталкиваются с потусторонней угрозой.